石河子大學機械電氣工程學院具有悠久的辦學歷史，其前身為1959年成立的中國人民解放軍新疆生產(chǎn)建設兵團農(nóng)學院農(nóng)業(yè)機械化系。1996年9月石河子大學成立后更名為石河子大學工學院機械電氣工程系。2001年成立機械電氣工程學院。

學院設有4個系、3個辦公室、1個圖書資料室和1 個CAD。擁有國家教育部工程1個；省實驗室1個、檢驗測試1個、職業(yè)技能鑒定站1個；精品課程2門；特色專業(yè)1個、品牌專業(yè)1個、精品課程3門、一類課程6門；二級學科碩士學位點3個；農(nóng)業(yè)工程與農(nóng)業(yè)推廣專業(yè)碩士點2個；農(nóng)業(yè)機械化及其自動化、機械設計制造及其自動化、電氣工程及其自動化與工業(yè)工程4個本科專業(yè)；并設有成人教育及高等職業(yè)教育，形成了研究生教育、本科生教育、高職教育等多層次多形式的辦學格局。

石河子大學機械電氣工程學院實驗源于1959年原石河子農(nóng)學院農(nóng)機系農(nóng)機化專業(yè)實驗室，是在機械電氣工程學院現(xiàn)有機械工程實驗、電氣工程和工程訓練的基礎上組建而成的。由于實驗在產(chǎn)、學、研和大學生創(chuàng)新能力、實踐動手能力等綜合素質(zhì)培養(yǎng)方面取得了可喜的成績并形成了特色。2005年，在實驗建設的基礎上取得了“兵團農(nóng)業(yè)機械實驗室”和“兵團農(nóng)業(yè)機械檢測”，2006年又取得了“綠洲經(jīng)濟作物生產(chǎn)機械化教育部工程研究”,2008年進入校級實驗教學示范建設行列。